Молекулярная филогенетика
Bioinformatics Institute via Stepik
-
15
-
- Write review
Overview
Курс посвящён основам филогенетики и современным методам, применяемые для построения филогении по данным последовательностей нуклеиновых кислот или белков. Кроме того, мы рассмотрим некоторые другие темы, необходимые для понимания закономерностей эволюции.
Syllabus
Введение. Необходимая терминология. Знакомство с деревьями
1.1 Введение
1.2 Подходит ли Вам этот курс?
1.3 Необходимая терминология
1.4 Практические аспекты обращения с деревьями
Выравнивание нуклеотидных и белковых последовательностей
2.1 Алгоритмы попарного выравнивания
2.2 Особенности выравнивания белковых последовательностей
2.3 Множественное выравнивание
2.4 Базы данных последовательностей
Методы построения и проверки деревьев
3.1 От выравнивания к дереву
3.2 Методы расстояний: UPGMA, NJ
3.3 Дискретные методы: MP, ML
3.4 Сравнение и укоренение деревьев
3.5 Тестирование топологии
3.6 Bootstrap, jackknife
3.7 Немного о байесовской статистике
3.8 Байесовские методы восстановления филогении
3.9 Байесовские методы для датировки
Эволюция гена и генома
4.1 Терминология генетики популяций и закон Харди-Вайнберга
4.2 Факторы, влияющие на популяцию
4.3 Коалесцентные методы
4.4 Гомология последовательностей и семейства генов
4.5 Маркерные гены
4.6 Заключение
Taught by
Polina Drozdova and Oleg Tarasov
Tags
Related Courses
-
Введение в NGS. Часть 1
Bioinformatics Institute
-
Введение в биоинформатику (Introduction to Bioinformatics)
Saint Petersburg State University
5.0 -
Биотехнологии: генная инженерия
Bioinformatics Institute
-
Введение в Биоинформатику: Метагеномика (Introduction to Bioinformatics: Metagenomics)
Saint Petersburg State University
-
Умная аналитика в управлении образованием
Higher School of Economics
-
Введение в теорию построения процедур множественной проверки гипотез
Higher School of Economics
Reviews
0.0 rating, based on 0 reviews